Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2FP61218 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2FP61218 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms