Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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UBE2NP61088 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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UBE2NP61088 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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UBE2NP61088 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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UBE2NP61088 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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UBE2NP61088 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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