Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX2P58304 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX2P58304 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX2P58304 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms