Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC16A1P53985 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms