Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLIP1P30622 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP1P30622 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms