Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms