Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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HOXD10P28358 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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HOXD10P28358 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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HOXD10P28358 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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HOXD10P28358 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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