Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLD1P28340 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLD1P28340 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLD1P28340 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLD1P28340 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLD1P28340 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLD1P28340 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLD1P28340 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD1P28340 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms