Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms