Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALB2P22676 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALB2P22676 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALB2P22676 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALB2P22676 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALB2P22676 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALB2P22676 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALB2P22676 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALB2P22676 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALB2P22676 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALB2P22676 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALB2P22676 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALB2P22676 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALB2P22676 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALB2P22676 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALB2P22676 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALB2P22676 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALB2P22676 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CALB2P22676 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALB2P22676 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALB2P22676 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALB2P22676 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALB2P22676 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALB2P22676 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALB2P22676 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALB2P22676 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALB2P22676 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALB2P22676 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALB2P22676 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALB2P22676 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALB2P22676 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALB2P22676 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms