Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAV1P15498 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VAV1P15498 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAV1P15498 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAV1P15498 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VAV1P15498 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAV1P15498 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAV1P15498 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAV1P15498 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAV1P15498 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAV1P15498 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAV1P15498 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAV1P15498 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAV1P15498 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAV1P15498 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms