Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms