Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms