Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBP07199 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CENPBP07199 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CENPBP07199 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CENPBP07199 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CENPBP07199 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CENPBP07199 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBP07199 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBP07199 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBP07199 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBP07199 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBP07199 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBP07199 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBP07199 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBP07199 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBP07199 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBP07199 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBP07199 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBP07199 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBP07199 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBP07199 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBP07199 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBP07199 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBP07199 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBP07199 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBP07199 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBP07199 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBP07199 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms