Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSD2O96028 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSD2O96028 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSD2O96028 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSD2O96028 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSD2O96028 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSD2O96028 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSD2O96028 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSD2O96028 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NSD2O96028 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSD2O96028 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSD2O96028 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSD2O96028 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSD2O96028 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSD2O96028 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSD2O96028 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSD2O96028 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NSD2O96028 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NSD2O96028 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NSD2O96028 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD2O96028 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD2O96028 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms