Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX6O95503 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX6O95503 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX6O95503 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CBX6O95503 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CBX6O95503 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CBX6O95503 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CBX6O95503 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX6O95503 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX6O95503 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX6O95503 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms