Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms