Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX1O43812 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX1O43812 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX1O43812 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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