Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLX3O43711 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TLX3O43711 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TLX3O43711 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TLX3O43711 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TLX3O43711 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TLX3O43711 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TLX3O43711 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TLX3O43711 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms