Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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