Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms