Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms