Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TO15178 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TO15178 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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