Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AL162385.1-201ENST00000451595 1202 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNPHO15079 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 FP565260.4-201ENST00000624081 513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SNPHO15079 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 PTP4A2-201ENST00000457805 1032 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC109466.1-206ENST00000522686 774 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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