Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE40O14503 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE40O14503 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE40O14503 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE40O14503 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE40O14503 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE40O14503 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE40O14503 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE40O14503 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE40O14503 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE40O14503 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE40O14503 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE40O14503 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE40O14503 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
BHLHE40O14503 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms