Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms