Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIP1O00291 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIP1O00291 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIP1O00291 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HIP1O00291 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIP1O00291 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIP1O00291 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HIP1O00291 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIP1O00291 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIP1O00291 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIP1O00291 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HIP1O00291 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIP1O00291 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIP1O00291 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIP1O00291 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIP1O00291 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIP1O00291 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIP1O00291 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIP1O00291 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIP1O00291 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIP1O00291 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIP1O00291 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIP1O00291 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIP1O00291 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIP1O00291 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIP1O00291 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIP1O00291 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIP1O00291 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIP1O00291 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIP1O00291 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIP1O00291 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIP1O00291 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIP1O00291 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIP1O00291 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIP1O00291 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIP1O00291 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms