Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED3Q9Y3Q3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED3Q9Y3Q3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms