Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B2

EXOSC1, Exosome complex component CSL4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC1Q9Y3B2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EXOSC1Q9Y3B2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC1Q9Y3B2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC1Q9Y3B2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC1Q9Y3B2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC1Q9Y3B2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC1Q9Y3B2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC1Q9Y3B2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC1Q9Y3B2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC1Q9Y3B2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC1Q9Y3B2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC1Q9Y3B2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC1Q9Y3B2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC1Q9Y3B2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC1Q9Y3B2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC1Q9Y3B2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC1Q9Y3B2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC1Q9Y3B2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC1Q9Y3B2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC1Q9Y3B2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.6 ms