Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNIP3Q9Y2W7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNIP3Q9Y2W7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNIP3Q9Y2W7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNIP3Q9Y2W7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNIP3Q9Y2W7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNIP3Q9Y2W7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNIP3Q9Y2W7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNIP3Q9Y2W7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNIP3Q9Y2W7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNIP3Q9Y2W7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNIP3Q9Y2W7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms