Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIPT1Q9Y234 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIPT1Q9Y234 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIPT1Q9Y234 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIPT1Q9Y234 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIPT1Q9Y234 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIPT1Q9Y234 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms