Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX6Q9UPM6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX6Q9UPM6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms