Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC12A4Q9UP95 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC12A4Q9UP95 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 442.5 ms