Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAV3Q9UKW4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAV3Q9UKW4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAV3Q9UKW4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms