Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms