Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHMP5Q9NZZ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CHMP5Q9NZZ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms