Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLCO1C1Q9NYB5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1C1Q9NYB5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLCO1C1Q9NYB5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.9 ms