Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB20Q9NX57 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB20Q9NX57 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms