Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTN9

SEMA4G, Semaphorin-4G, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4GQ9NTN9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4GQ9NTN9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4GQ9NTN9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4GQ9NTN9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms