Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTM9

CUTC, Copper homeostasis protein cutC homolog, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTCQ9NTM9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUTCQ9NTM9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUTCQ9NTM9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 513.5 ms