Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT82Q9NSB4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms