Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SH2B1Q9NRF2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms