Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB18Q9NP72 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB18Q9NP72 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms