Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD90

NEUROD4, Neurogenic differentiation factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD4Q9HD90 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEUROD4Q9HD90 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEUROD4Q9HD90 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD4Q9HD90 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms