Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIF1Q9H611 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms