Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA6AQ9H2E6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms