Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX5Q9H2C1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX5Q9H2C1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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