Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE41Q9C0J9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE41Q9C0J9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms