Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms