Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UPF3BQ9BZI7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UPF3BQ9BZI7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms